Рутокен S — это модельный ряд токенов которые между собой отличаются объемами памяти (32КБ, 64КБ, 128КБ) для хранения ключевых пар и сертификатов. Могут быть в корпусе стандартного исполнения или micro. Есть сертификация ФСТЭК (ндв3 и ндв4). Для работы требуется устанавливать специальный драйвер.
Рутокен Lite — это ближайший аналог для Рутокен S. Работает на внутреннем (встроенном) драйвере операционной системы (CCID). Объем памяти фиксированный (64КБ). Могут быть в корпусе стандартного исполнения или micro. Есть сертификация ФСТЭК (ндв4).
Функционально эти модели идентичны — используются как защищенные носители для хранения ключей и сертификатов электронной подписи.